À partir de la rentrée 2012, le master mention Mathématiques et applications propose quatre spécialités:
la spécialité Mathématiques et enseignement (ME);
la spécialité Mathématiques fondamentales et appliquées (MFA);
la spécialité Mathématiques appliquées et sciences sociales (MASS);
la spécialité Ingénierie mécanique (IM).